Omicron 变种 BA.2.86 传播速度更快，但目前的抗病毒药物坚守阵地

在最近上传到bioRxiv预印本*服务器的一篇研究论文中，研究人员评估了一种名为 BA.2.86 的新型严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) Omicron 谱系的病毒学特征。他们进行了流行病动力学模型，使用当前临床可用的抗病毒药物进行实验研究，并使用仓鼠进行融合性研究。他们的研究结果表明，相对于全球主导的 Omicron EG.5.1，BA.2.86 的复制数量要高得多。

令人鼓舞的是，目前可用的四种抗病毒药物可以有效治疗该新亚株，并且该菌株（在仓鼠中）的致病性远低于亲本 BA.2 菌株。研究人员将致病性降低归因于生长动力学低下和繁殖能力降低。

变种太多了！

自 2019 年底爆发以来，导致 2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 大流行的严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 已夺去了超过 690 万人的生命。该病毒首次在中国武汉发现，该病毒是一种正义单链RNA病毒。该病毒的祖先是蝙蝠的宿主，但由于其固有的高突变率，基因溢出事件导致其能够以高致病性感染人类。

人类新冠病毒的祖先被西方研究人员标记为“A”型祖先，保留了其亲本的高突变能力，导致目前存在数千种 SARS-CoV-2 变种。值得注意的是，“B”型是造成大流行的原因。根据致病性以及对疫苗接种和临床干预的敏感性，世界卫生组织 (WHO) 将 B 型谱系进一步标记为“α”、“β”、“γ”、“δ”以及最近的“omicron”。 ”

Omicron 变种于 2021 年 11 月 24 日在南非博茨瓦纳首次检测到并被识别，科学上称为“B.1.1.529”，特别是其后代 XBB.1.9.2.5.1（现称为“EG.5.1）”迄今为止，全球范围内最流行、最具破坏性的 SARS-CoV-2 变种，也是唯一保留 WHO“关注变种”标签的 COVID-19 病毒。然而，2023 年 8 月 14 日，XBB 的新后裔被标记为 BA .2.86 被发现在刺突 (S) 蛋白中有超过 30 个突变。

鉴于 S 蛋白在感染性和免疫逃避中发挥的关键作用，世界卫生组织于 2023 年 8 月 17 日将 BA.2.86 指定为需要紧急监测的变种，并率先对其病毒特征进行研究。到 2023 年 10 月 31 日，该变种已在全球范围内得到确认，但浓度较低。据推测，该变种的突变速度比其祖先更快，迄今为止已发现 1,400 多个病毒序列。

研究调查了该病毒的免疫逃避潜力以及特定的病毒学特征，特别是其与人类受体结合域（RBD）的亲和力。然而，其突变率以及对其感染性、生长动力学和体内内在致病性的评估仍然缺乏。

关于该研究

在本研究中，研究人员旨在研究 BA.2.86 谱系的体外和体内病毒学特征，特别是其在仓鼠中的流行潜力、RBD 亲和力、生长动力学、免疫逃避潜力和融合性。他们进一步测试了当前临床可用的抗病毒药物对抗这种疾病的功效。

BA.2.86 的流行潜力是通过使用来自六个变异流行率高的国家的基因组监测数据估计其相对有效 119 繁殖数 (R_{e ) 来评估的。}使用多元贝叶斯分层多项逻辑模型来计算特定国家的 Re_以及全球外推。

使用酵母展示技术估计 BA.2.56 的结合亲和力。将新变体的 S 蛋白 RBD 与 ACE2 受体的结合与 XBB.1.5 的结果进行比较，XBB.1.5 描述了迄今为止所有已知的 COVID-19 变体的最高结合亲和力。然后他们使用基于 HIV-1 的假病毒测试了这种新型病毒的感染潜力。使用衍生的假病毒的蛋白质印迹来评估BA.2.86S蛋白的切割效率。

使用S 192蛋白介导的膜融合测定在体外进行BA.2.86的融合性，其中估计Calu-3/DSP_1-7细胞中的表面表达水平。

第218章 第218章（n = 17）。”

使用接种BA.2.86的Vero细胞来研究病毒的体外生长动力学。随后，测量了新变体针对 nirmatrelvir、ensitrelvir、remdesivir 和 EIDD-1931 的抗病毒敏感性。最后，在仓鼠体内测试了 BA.2.86 的致病性。

研究结果

BA.2.86 的流行潜力被发现是所有已知 Omicron 变种中最高的，全球 R_e估计比 EG.5.1 高 1.07 倍。鉴于 BA.2.86 的流行率不断上升，尤其是在欧洲国家，这一点值得注意，并表明该新变种最终将取代 EG.5.1 成为全球主导的 COVID-19 毒株。结合亲和力测定表明，BA.2.86 的结合力与 XBB.1.5 相当，并且显着高于 EG.5.1 或其亲本 BA.2。

假病毒感染性测定显示，在体外，EG.5.1 胜过 BA.2.86，后者的感染性与其亲本 BA.2 株相当，这也是在体外融合性中观察到的病毒特征。然而，BA.2.86 的切割效率明显高于祖先 BA.2 菌株。

免疫逃避测定表明，BA.2.86 的免疫逃避潜力明显强于 BA.2 和 EG.5.1。然而，生长动力学分析表明，该新菌株的生长效率远低于目前优势菌株EG.5.1。

“感染后 72 小时 (hpi) 的免疫荧光测定进一步显示 238 感染 BA.2.86 的 VeroE6/TMPRSS2 细胞表现出比感染 EG.5.1 的细胞更低的 GFP 强度 239。这些结果表明 BA.2.86 240 显示出较差的复制能力与 EG.5.1 和 BA.2 相比。"

所有四种测试的抗病毒药物都对 NA.2.86 表现出良好的疗效，其中 Nirmatrelvir 显示出最佳疗效，而 EIDD-193 最差（但仍呈阳性）。仓鼠体内测试表明，BA.2.86 感染导致体重减轻和肺功能下降。然而，与 EG.5.1 感染相比，这些参数的效力明显较低。病毒RNA负载评估显示了相似的结果（与EG.5.1甚至祖先BA.2相比，BA.2.86负载较低），表明BA.2.86具有较低的体内复制效率。

结论

本研究评估了最近发现的 BA.2.86 Omicron COVID-19 变种的病毒特征。多重分析研究表明，尽管这种新型病毒比目前占主导地位的 EG.5.1 变种具有更大的融合性、结合亲和力和流行潜力，但它可以减轻仓鼠的严重感染并减少病毒载量。

“这种差异 290 可以通过 BA.2.86 的复制能力来解释。事实上，我们表明，在体外细胞培养中，BA.2.86 的复制动力学显着低于 BA.2（至少在 Vero 细胞中）因此，我们的结果表明 BA.2.86 的致病性减弱归因于其复制能力的降低。”